同時期，香港房屋協會也在2006年宣佈開展石水渠街一帶的活化及保育項目，初步構思一級歷史建築藍屋及三級歷史建築黃屋會被保留用作以茶及醫療為主題的旅遊景點，橙屋則會被拆卸並結合旁邊空地發展為休憩場所。原有居民將全體被遷出，附近的車庫及小商戶面臨被淘汰的命運，原本累積多年的社區網絡將因重建而破壞。後來聖雅各福群會聯同各界人士一同組織街坊參與討論，同時參考了利東街居民的方案，提出以留屋留人的方式活化及保存藍屋建築群，建議最終獲得發展局接納。2008年，發展局推出「活化歷史伙伴計劃」，並將藍屋建築群活化，透過有關計劃的第二期以公開招標形式批出。2010年，聖雅各福群會、社區文化關注、香港文化遺產基金會和藍屋居民權益小組聯合申請的計劃獲批，2012年獲立法會撥款，從2013年開始工程直到2017年復修完成。